Når wagyu kvæget er 6 måneder gammelt, får det sit eget ID, hvis det opfylder en række krav ift. sygdomme, handicap osv. Hvis kvæget er sundt og rask, får det sit ID, før det i en alder af syv måneder bliver solgt på auktion til de præfekturer, der opdrætter wagyu. Dette kunne fx være Kagoshima, Gunma eller Hokkaido.
På ID’et kan du se fødested, næseprint, fødselsdag, køn, fodringsperioden og kvægets stamtræ. Stamtræet går tre generationer tilbage og viser kvægets forældre, bedsteforældre og oldeforældre. Det siges, at japanerne faktisk kan følge stamtræene og spore kvæget tilbage til forfædre fra det 14. århundrede. Når du spiser en japansk wagyu bøf, kan du med koens ID kende alt til kvægets historie.